手术时，医生用一个阴道扩张器将仰卧患者的子宫颈暴露并清洗，用以去掉子宫颈黏液并检查子宫颈口的通畅状况 。随后，挑选好的胚胎被实验室技术人员吸进一条移植导管并递给医生，医生将移植导管通过子宫颈送入子宫，把含有胚胎的液体注射到子宫腔内 。
移植过程中，大多数医生会使用超声仪边观察边进行移植胚胎，以此来准确地掌握胚胎的移植的位置，明显的提高怀孕率 。
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