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火爆的约翰尼·德普还曾因为与凯特摩丝发生争吵，愤而捣毁了纽约一个每晚两千美元的旅馆房间，并因此被捕入狱 。
1997年后，约翰尼·德普爱上了法国女演员兼歌手凡妮 莎帕哈迪丝，1999年五月凡妮莎还为他生下了女儿 ，取名百合玫瑰（Lily-Rose） 。
从此以后曾被人喻为好莱坞坏小孩的约翰尼·德普开始转性，完全是一副奶爸形象见人，常常被狗仔队拍到他提著大包小包尿布或是推著婴儿车戴女出门的天伦模样，跟他以往颓废的形象简直有著天壤之别 。
或许是因为孩子的出生，德普选择接拍的电影也开始转变风格 。
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2003年，他在电影《加勒比海盗：黑珍珠号的诅咒》中以另类的表演风格获得了第76届奥斯卡金像奖最佳男主角的提名，这部电影原本并不被看好，甚至在迪士尼电影中只是三流制作，不过正式因为德普叔的表演，让这部电影全球横扫6亿多的票房 。
正是因为这部《加勒比海盗》让德普跻身为全球最具票房号召力的男星行列，成为名副其实的好莱坞顶级巨星 。之后他又出演了这部电影的续集，德普那奇异的扮相和演技受到影迷的追捧 。
在《加勒比海盗》两部电影的拍摄间隙，德普还抽空拍摄了不少影片，包括《浪荡子》《寻找梦幻岛》和《秘窗》等 。影片《寻找梦幻岛》还为他带来第77届奥斯卡最佳男主角奖的提名 。
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2005年，他和老友蒂姆·波顿合作，除在动画片《僵尸新娘》中献声外，还主演了《查理和巧克力工厂》，扮演的是一个怪异的巧克力工厂的主人 。《查理和巧克力工厂》改编自罗尔德-达尔的同名小说，影片虽然是一部童话故事，但其内容却有些黑暗 。
2006年德普主演的《加勒比海盗：聚魂棺》上映，影片全球票房突破十亿美元 。
2007年，他主演由蒂姆·波顿执导的改编自当年一部得到百老汇托尼奖的同名音乐剧《理发师陶德》，获得第65届美国电影金球奖最佳男主角 。
同年，他和克里斯蒂安·贝尔联袂出演迈克尔·曼执导的黑帮警匪片《公众之敌》 。影片根据真实事件改编，约翰尼·德普饰演了20世纪30年代臭名昭著、抢遍了美国中西部银行的超级银行大盗约翰·迪林格 。同年，他主演的 《加勒比海盗：世界的尽头》上映 。
2010年，约翰尼·德普与导演蒂姆伯顿合作3D真人动画《爱丽丝梦游仙境》，影片全球票房10.24亿美元 。此外，他与安吉丽娜·朱莉联袂主演的浪漫惊悚片《致命伴侣》 。
同年，德普主演的《加勒比海盗：惊涛怪浪》全球票房超过10亿美元，也使他成为好莱坞最吸金男演员之一 。由他主演的四部《加勒比海盗》电影，票房总收入37.27亿美元 。
同年，他出演了科幻惊悚片《超验骇客》，约翰尼·德普饰演的科学家将因为超验骇客技术成为智能永生人 。《超验骇客》北美上映首日（周五）只排名票房榜第四，约翰尼·德普再一次遭遇超大型的票房滑铁卢 。
2016年，约翰尼·德普和艾梅伯·希尔德离婚，已走法律程序，女方在5月22日申请离婚，两人结婚仅15个月 。
2人婚变的内幕，疑似因为婆媳问题让婚姻走向尽头，最后以难以化解的歧异为由向法院提出离婚 。