唐武德五年为饶州治 。天宝元年 （742年） 为鄱阳郡治 。乾元元年（758年）复为饶州治 。元为饶州路治 。明为饶州府治 。1912年废府属省 。1914年属浔阳道 。1926年复属省 。
1952年属上饶专区 。1957年改名波阳县 。1971年属上饶地区 。2003年12月17日经民政部批准，波阳县恢复鄱阳县名 。
1983年7月，将波阳县的渔山公社及荷塘垦殖场划归景德镇市昌江区管辖（国函字[1983]146号） 。1984年5月24日，垦殖场设立高家岭乡，响水滩公社分设为响水滩乡、肖家岭乡，设置田畈街镇（赣府字[1984]117号） 。
1984年5月24日，波阳县设置九个区建制 。谢家滩区辖石门街乡、谢家滩乡、肖家岭乡；侯家岗区辖侯家岗乡；油墩街区辖银宝湖乡、油墩街乡、湖滨乡、莲山乡、桥头街乡、响水滩乡；田畈街区辖田畈街镇、田畈街乡、柘港乡、金盘岭乡、枧田街乡；高家岭区辖游城乡、珠湖乡、站前乡、高家岭乡；团林区辖四十里街乡、团林乡、磨刀石乡、双港乡；古县渡区辖古县渡乡、昌洲乡、古南乡；凰港区辖凰岗乡、东溪乡、太阳埠乡、神山乡；芦田区辖芦天乡、饶埠乡、桐山乡 。三庙前乡、莲湖乡、水上乡为县直辖乡（赣府字[1984]117号） 。
1985年4月18日，设立莲花山、莳山、白沙洲、聂家、鸦鹊湖乡（赣府厅字[1985]230号） 。1986年2月23日，撤销石门街乡，设置石门街镇（赣府厅字[1986]74号） 。1992年7月27日，撤销水上乡（赣民字[1992]138号批复） 。
1994年11月25日，撤销油墩街乡、谢家滩乡、四十里街乡、古县渡乡、双港乡、饶埠乡，设立油墩街镇、谢家滩镇、四十里街镇、古县渡镇、双港镇、饶埠镇（赣民字[1994]238号批复） 。至此，全县辖9个镇、32个乡：鄱阳镇、石门街镇、谢家滩镇、油墩街镇、田畈街镇、田十里街镇、双港镇、古县渡镇、饶埠镇、莲花山乡、肖家岭乡、侯家岗乡、响水滩乡、桥头街乡、莲山乡、枧田街乡、莳山乡、湖滨乡、碧山乡、柘港乡、金盘岭乡、鸦鹊湖乡、银宝湖乡、游城乡、珠湖乡、高家岭乡、白沙洲乡、站前乡、凰岗乡、东溪乡、聂家乡、太阳埠乡、团林乡、古南乡、神山乡、昌洲乡、磨刀石乡、莲湖乡、三庙前乡、芦田乡、桐山乡 。
1999年5月4日，饶丰综合垦殖场改制设立饶丰镇，镇政府驻红土山；乐丰良种繁殖场改制设立乐丰镇，镇政府驻包家（赣民字[1999]112号批复） 。2000年6月27日，撤销金盘岭乡、高家岭乡、凰岗乡，设立金盘岭镇、高家岭镇、凰岗镇（赣民字[2000]143号批复） 。至此，全县辖14个镇、29个乡 。
2000年，根据第五次人口普查数据：全县总人口1191526人，其中各乡镇人口（人）： 鄱阳镇 101313 石门街镇 19576 田畈街镇 26053 谢家滩镇 54506 四十里街镇 29645 双港镇 53468 古县渡镇 38577 饶埠镇 42491 油墩街镇 29393 乐丰镇 9264 饶丰镇 33734 金盘岭镇 30289 高家岭镇 10011 凰岗镇 20408 桥头街乡 17128 肖家岭乡 14061 候家岗乡 27797 莲花山乡 11159 银宝湖乡 18946 湖滨乡 16319 莲山乡 11557 响水滩乡 23658 鸦鹊湖乡 11265 碧山乡 18161 柘港乡 37009 枧田街乡 23340 莳山乡 10198 游城乡 43136 珠湖乡 25555 站前乡 17550 白沙洲乡 6992 团林乡 34466 磨刀石乡 46008 聂家乡 8912 昌洲乡 25382 古南乡 35007 东溪乡 13736 太阳埠乡 10661 神山乡 12480 芦田乡 44591 桐山乡 16235 丰庙前乡 54072 莲湖乡 57417
2001年12月3日，撤销磨刀石乡，划归鄱阳镇；撤销莳山乡，划归田畈街镇；撤销聂家乡，划归双港镇；撤销站前乡，划归高家岭镇；撤销湖滨乡，划归油墩街镇（赣民字[2001]570号批复） 。
2003年10月21日，撤销东溪乡、太阳埠乡、神山乡，成建制划归凰岗镇管辖；撤销碧山乡，成建制划归田畈街镇管辖（赣民字[2003]273号批复） 。2003年底，全县总人口138万人 。

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