目前流脑的治愈率可达95%%以上 。一般死亡病例多为暴发型 。暴发流脑根据临床症状的不同又分为休克型、脑膜炎型和混合型，如果抢救不及时，往往造成死亡 。因此治疗暴发型流脑，除使用抗生素外，还应积极抗休克，消除脑水肿，防止脑疝，防止呼吸衰竭 。
此外还有一种轻型流脑，一般是在流行后期出现，起病较缓，病势也轻，体温不高，神志清楚，没有淤斑，只是有鼻咽炎症状和少量小的出血点 。普通型患儿早期采用适应药物能够彻底治疗，并发症和后遗症也很少，因此小儿患流脑后，一定要彻底治疗 。小孩患过病后就可获得巩固的免疫力，一般不再感染流脑 。
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