因此，许多科学家认为，尼安德特人的婚配制度导致其遗传多样性大大降低 。在其与智人争斗的相关论述中，我们提到尼安德特人的种群结构简单，内部的人口数量也很少 。
根据推测来看，他们的婚配就是在20人左右的小群体当中进行的 。这样几轮交配之下，必然会发生近亲结婚的现象，导致后代的基因不好甚至直接夭折 。

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德国马克斯·普朗克演化人类学研究所的研究小组通过对从某女性尼人化石上提取到的基因测序发现，该女性尼人是近亲繁殖的产物——她的父母是同父或同母的兄妹 。
可见，近亲繁殖的现象在尼安德特人的群体当中应该是存在的 。至于到底是不是科学家们想象中的那么严重，就需要发现更多的化石才能够证明了 。但如果真的近亲繁殖很严重，那么尼安德特人的灭绝肯定和这一原因有着密切的关系 。
其他的灭绝假说上文中，我们从环境、争斗和遗传多个方面，分别对这一强壮人种为何会灭绝，作出了相关的解释 。但是以上理论也都是猜想，虽然有相关的证据支撑，却也不是定论 。学界对于尼安德特人的灭绝猜测可谓是众说纷纭，就让我们来看看科学家们还提出了哪些灭绝的假说吧 。

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首先，就是地球磁极的变化 。《科学》杂志上曾经刊登过这样一篇论文，其描述42000年前的地球曾经历了磁极逆转事件 。该事件使得地球磁场减弱，宇宙辐射得以进入地球，对地球环境造成了改变 。
而这种情况使得那时期的古人类更需要寻找“洞穴”作为庇护所，科学家表示考古证据也表明那一时期的智人对于洞穴也更加热衷 。并且洞穴当中的“红赭手印”可能就是他们制造的“防晒剂”，两个人种对于洞穴的需求必然会引发相应的冲突 。所以说，磁极变化可能是尼安德特人灭绝的一个重要原因，却不是唯一的原因 。

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其次，就是“因眼睛过大而灭亡”的猜测 。英国牛津大学的某个研究小组就针对这一问题展开了研究，他们通过对比32个现代人和13个尼安德特人的头骨之后发现，他们的眼眶要比现代人长6毫米左右 。

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而眼睛大会使得他们分出更多的大脑区域给视觉，这样思考的能力也许就减少了 。简单来说，就是相比智人不够聪明，因此无法快速适应环境 。不过，这一假说也有不少科学家表示反对，例如英国杜伦大学的罗伯特·巴顿教授 。
罗伯特·巴顿教授认为大眼睛和大脑使用之间的关联度并不强 。例如同属灵长目的眼镜猴就拥有巨大的眼睛，不过它们大脑中的视觉系统却非常小 。
可见，有关于尼安德特人灭绝的猜测确实是太多了 。在没有更多化石证据出现之前，任何一种说法都只是存在于“假设”当中，想要证明，就必须得到更多强有力的证据 。

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