而随着高新技术产业的发展 ， 优惠政策在有效实施中遇到了一些问题 ， 主要表现为：扶持力度较小且不配套；国家政策、地方政策和开发区内政策缺乏协调一致；有些政策未能体现高新区的特点；有些地区搞优惠政策的盲目攀比 ， 使优惠政策过多、过滥 。这些问题的出现 ， 影响了高新技术产业的发展 ， 从高新区的发展来看 ， 高新区的优惠政策既要发挥引导功能 ， 又要发挥调控功能 ， 应从以下几方面注意完善 。
（一）在优惠政策上采取明确的产业倾斜政策
高新技术产业开发区的优惠对象是经核定的高新技术企业 ， 其侧重企业的技术层次 ， 经认定的高新技术企业满三年以后 ， 需要经过重新认定 ， 才能继续享受优惠 ， 可见高新技术产业对企业技术要求很高 。我国高科技及其产业化的任务 ， 就是要把握国际高科技发展的趋势 ， 以提高国家自主创新能力、掌握知识产权、增强综合国力为目标 ， 重点开发电子、生物、新材料、新能源、航空、航天、海洋等方面的高技术 ， 现在我国的多数高新技术产业开发区都是按照国家科委根据世界科学技术发展状况划定的高新技术范围 ， 规定本地的国家高新技术开发区的发展领域 。每个开发区都根据自己的资源、人文、地理优势 ， 按照自己的实际条件突出当地的优势 ， 兼容当地经济、科技、历史文化特色 ， 特别强调了有关的发展领域 ， 如 ， 昆明市首先规定了“发展生物工程技术及其产品”、“信息技术及其产品” 。石家庄市规定“发展通讯、微电子、生物医药、机电一体化、新材料、高效能等新技术及其产业” 。上海漕河泾开发区在产业政策的引导下形成了现代信息、生物医药工程和新型材料三大支柱产业 。天津开发区形成了电子、机械、生物工程、食品等四大产业群 。因此 ， 在优惠政策上 ， 应注意产业倾斜政策的制订 ， 要体现产业政策和区域政策相结合 ， 产业政策区域化和区域政策产业化的特点 ， 要明确规定哪些产业应当给予特别的鼓励 ， 真正体现优惠政策既为高新技术企业服务 ， 又为高新区调整产业结构 ， 长期协调发展服务 。只有这样国家才可以通过政策的制定 ， 引导高新技术产业开发区的产业布局向合理、协调、互补的方向发展 。在引导高新技术产业开发区优先发展主导产业的同时 ， 还要注意其他产业的发展 ， 培植新的经济增长点 。这样就可以形成以一个或者几个产业为主体 ， 多个产业同步协调发展的新的合理的产业布局 。
我国目前应当根据高新技术产业开发区存在的经济总量偏少 ， 企业规模不大、技术层次偏低 ， 科技含量不高的特点 ， 制定重点扶持大型高新技术企业的优惠政策 ， 把提高经济增长质量和效益放在首位 ， 努力促进经济增长方式由粗放型向集约型转变 ， 要采取扶持政策 ， 以名牌产品和优势企业为龙头 ， 以资产为纽带 ， 以分工协作实现资源优化配置为原则 ， 积极推进联合、兼并、收购、参股等多种形式来进行资产重组和企业组织调整 ， 加快形成一批支柱产业和主导产业 ， 造成一批行业龙头企业和名牌产品 ， 使之上规模、上水平 ， 以增强在国际国内市场上的竞争能力 ， 确保开发区经济持续、健康、快速的发展 。在注重大企业发展的同时 ， 也不能忽视为数众多的中小型科技企业的成长 ， 中小企业是经济发展的基础 ， 与大企业在生产合作、产品配套等方面相互依存 ， 相互补充 。从某种意义上讲 ， 中小型科技企业技术创新甚至比大企业更活跃 ， 今天的小企业可能就是明天的大企业 。而扶持企业由小到大的成长 ， 正是高新区的责任和最具特色的功能之一 。

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