后来，在为孩子求医的同时，她多次向各部门投诉绵阳开元医院。
在余亚萍家中，红星新闻采访人员发现了多份绵阳市、游仙区两级卫生部门的投诉答复函。
余亚萍说，对于儿子的现状，她认为当时给她做四维彩超的绵阳开元医院负有不可推卸的责任。
医院漏诊：
愿承担漏诊责任但非全部责任
多方协调后，医院支付家属100余万
天眼查显示，绵阳开元医院全称为绵阳开元医院有限公司，注册日期为2016年9月6日。事发时，该医院刚成立不久。
该医院一位负责人曾向红星新闻采访人员表示，事情发生后，医院就积极配合余亚萍到华西医院、西南儿童医院等进行检查，积极和余亚萍进行沟通协调。
据医院负责人介绍，当事医生以前是另外一家医院的超声专家，就按照他的习惯和以前的模板出具了超声报告。现在来看，这份报告用语并不规范，医院后来也进行了完善。
同时，该负责人表示，超声检查属于影像学范畴。以目前的医学技术水平，还不能做到100%查出所有的胎儿畸形。余亚萍儿子身体缺陷不是医院超声检查造成，是医生出现了漏诊，“当事医生早已经辞职，医院愿意承担漏诊的相应责任，但不应是余亚萍儿子身体缺陷的全部责任。”
红星新闻采访人员获悉，事发后，绵阳市和游仙区两级卫健部门均介入调查此事。但从证据上看，无法认定绵阳开元医院存在产前诊断或产前筛查行为。
同时，卫健部门组织双方进行了多次协调，但余亚萍一方认为应该按人身伤害损害进行赔偿。院方则主张只赔偿漏诊责任，赔偿金额上存在巨大分歧。
11月2日，余亚萍告诉红星新闻采访人员，后来，经当地政府和相关部门协调，绵阳开元医院赔偿了她100万元多一点，“应该是叫赔偿，包括了后续的治疗费等，相当于是一次性解决。100多万元已经分3次支付完了。”
提起诉讼：
投诉另一家产检医院非法行医
未获认定起诉至法院 两审均被驳回
“后来我发现，此前一直做产检的四川省科学城医院，做产检时医生签字栏签的是护士名字，我又投诉该医院非法行医。”余亚萍说，近一年多来，因不满投诉之后得到的回复，她一直在起诉四川省科学城卫健委和科学城办事处。
红星新闻采访人员看到，余亚萍投诉之后，四川省科学城卫健委作出了《关于余亚萍投诉四川省科学城医院非法行医行为的回复》。
这份回复表示，签字的两人均有《护士资格证书》和《母婴保健技术考核合格证书》。余亚萍产前随访日，两人按照相关法律规定，执行医嘱，为余亚萍进行孕产期保健服务。不过，两人签名签到了“随访医生”栏，且签名不完整、不规范，已责令进行整改。
余亚萍对该回复不服，向科学城办事处提起复议。科学城办事处于2020年4月14日作出维持科学城卫健委关于余亚萍投诉科学城医院非法行医行为的处理决定。
同年4月30日，余亚萍因不服科学城办事处作出的复议决定，向法院提起诉讼。
绵阳经开区法院审理后认为，两名护士对余亚萍进行体格检查和产科检查，属于护士职业范围。两人虽然在产前服务记录表中“随访医生”栏错签姓氏，存在病历书写不完整、不规范行为，但其二人并未对疾病作出判断，亦未实施任何消除疾病、缓解病情、减轻痛苦、改善功能、延长生命、帮助患者恢复健康的活动。二人的行为不属于“诊疗活动”，不构成“非法行医”。四川省科学城卫健委的回复，认定事实清楚，适用依据正确，程序合法。
2020年8月26日，绵阳经开区法院作出驳回余亚萍诉讼请求的判决。

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