第二 样本采集部位、病毒基因选取人为因素也会影响结果。根据中国国家卫健委颁布的《新型冠状病毒实验室检测技术指南》，采集标本的种类里有上呼吸道标本(咽拭子、鼻拭子、鼻咽抽取物)，下呼吸道标本(深咳痰液、呼吸道抽取物、支气管灌洗液、肺泡灌洗液、肺组织活检标本)，血液标本，血清标本，后来又增加了粪便、肛拭子。而在实际操作中，采取最多的是咽拭子、鼻拭子之类的上呼吸道标本。
有专家指出，新型冠状病毒感染是一个肺深处的感染，因此下呼吸道标本是最好的，病毒多、最易检测出来。不过，当病人咳嗽的时候，一些病毒确实是可以被带到呼吸道的相对上部，可供样本采集和检测。

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