化学学院：本科专业：化学、制药工程
现有化学一级学科博士点和硕士点，涵盖物理化学、分析化学、无机化学、有机化学、高分子化学与物理、新能源材料、环境化学、材料化学、食品安全与药物化学等9个二级学科博士点和硕士点 。拥有化学工程与技术一级学科下属的应用化学和生物化工2个二级学科博士点和硕士点 。且拥有药学一级学科硕士点，涵盖药物化学、药理学、药物分析学、药剂学等4个二级学科硕士点 。拥有材料科学与工程一级学科下属的材料物理与化学硕士点 。拥有制药工程全日制专业学位型硕士点 。拥有制药工程领域的工程硕士点 。化学学院建有化学和化工博士后科研流动站，涵盖物理化学、材料与无机化学、分析化学与食品安全、药学、能源与环境化工、工业催化等研究方向 。
梅努斯国际工程学院：本科专业：自动化、软件工程、数字媒体技术、电子信息工程
由福州大学与爱尔兰国立梅努斯大学合作成立，福建省首家“双注册学籍、双授学士学位、4+0培养模式”的中外合作办学机构 。
学科评估：
化学A-
管理科学与工程B+、工商管理B+
数学B、机械工程B、土木工程B、化学工程与技术B
法学B-、电气工程B-、电子科学与技术B-、计算机科学与技术B-、软件工程B-
马克思主义理论C+、材料科学与工程C+、信息与通信工程C+、设计学C+
建筑学C、环境科学与工程C、食品科学与工程C、城乡规划学C、公共管理C、美术学C
外国语言文学C-、生物学C-

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