嗜酸乳杆菌NCFM
动物双歧杆菌BB-12
乳双歧杆菌HN019和BI-07
鼠李糖乳杆菌LGG和HN001
罗伊氏乳杆菌DSM17938
发酵乳杆菌CECT5716
短双歧杆菌M-16V
其中，预防和治疗腹泻的研究证据最充分的两个菌株是鼠李糖乳杆菌LGG和动物双歧杆菌BB-12。
在康复后，如选择长期使用益生菌来维护肠道菌群健康，还可以使用多种菌株，或单一菌株使用一段时间后更换另一菌株。
此外，在选用益生菌产品中，还可以注意以下细节：
在包装上标注菌株名称(如LGG)而不只是菌种名称(如鼠李糖乳杆菌)的产品更为靠谱
【孩子|宝宝病毒感染腹泻吃什么药 如何预防病毒感染腹泻】注意产品所标示的活菌数含量，单次补充含量达到一定量，如1×109CFU数量级，比较容易达到治疗效果

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